Ypsili ist eine der wichtigsten befestigten Siedlungen der frühen Eisenzeit in der Südägäis. Ein großer Teil des städtischen Gefüges aus der archaischen Phase der Akropolis sowie die Befestigungsanlagen aus der geometrischen Periode wurden kürzlich freigelegt. In der weiteren Umgebung von Ypsili sind große Bauernhäuser aus der historischen Periode ans Licht gekommen. Die antike Stadt Ypsili, in Aprovatou, wurde in den frühen 1980er Jahren entdeckt.

Die ersten Ausgrabungen brachten wichtige antike Überreste ans Licht, wie den Tempel im Zentrum der Akropolis, Gebäude und Teile der Mauer sowie viele bewegliche Funde. Die Ausgrabung hat wichtige Funde zutage gefördert, die für die geometrische und archaische Periode auf den Kykladen und in der Ägäis im Allgemeinen wertvoll sind.